女性怀孕后，体内酶发生一定改变，对部分药物代谢过程有一定影响，当孕妇因并发各种疾病需要应用药物时，如果不了解孕产期间母体与胎儿生理特点和病理变化，以及药物作用规律，不合理用药，一些药物通过胎盘可以直接影响到胎儿。
孕早期是胚胎和胎儿器官形成，分化，迅速发育的阶段，胎儿对药物敏感性极高，药物可能对胎儿的某些器官和系统造成严重影响，比如导致胎儿畸形。因此这段时期最好不要吃感冒药，尤其不要服用对大脑发育有影响的感冒药.
如四环素类药，服用这类药物可导致骨骼发育障碍，牙齿变黄，先天性白内障等;链霉素及卡那霉素，可导致先天性耳聋，并损害肾脏;氯霉素可使骨骼机制受抑制，新生儿肺出血;磺胺可导致新生儿黄疸。
镇静类药物可导致胎儿发育迟缓，易患先天性心脏病，常见的症状有胎儿指(趾)短小，鼻孔通联。
雌激素摄入过多容易导致上肢短缺，女婴阴道腺病，男婴女性化;孕激素摄入过多容易导致女婴男性化，男婴尿道下裂。
已经出现停经，但没有去检查是否认识，坚持吃避孕药的女性，如果诊断出怀孕，应该立即做流产手术，因为在妊娠初期还在服用避孕药而自然流产的胎儿中，染色体不正常的占总数的48%，同时这些自然流产的胎儿还带有某种缺陷;有的胎儿患有先天性心脏病或肢体短缺，也与母体经常盲目服用避孕药有关。
孕期要使用中药调理的话，也要注意中药对孕妇本人和对胎儿的影响，以免用药不慎导致胎儿流产或胎儿畸形，能不用尽量不用的中药包括行气破滞，辛热滑利，活血行血，通经祛瘀的药物。
有的人认为孕期绝对不能用药，这种看法也是片面的，例如患心脏病的孕妇如果不及时治疗，一旦发生心力衰竭，不但自身危险，胎儿也可能缺氧而死亡;患糖尿病的孕妇如果不及时控制血糖，可能出现酮性酸中毒，危及生命;孕早期需要补充叶酸，维生素，因此一定要吃药的话，孕妇应该在医生指导下合理用药。
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